En mi grupo de investigación combinamos la información experimental con la computacional para establecer las bases energético-estructurales del funcionamiento de proteínas y su formación de complejos con otras biomoléculas (proteínas, lípidos, carbohidratos y DNA). Lo anterior para explicar el mecanismo molecular de un determinado proceso biológico en condiciones normales o ligado a una enfermedad, así como para el diseño racional de fármacos o el reposicionamiento de fármacos. Los estudios los realizamos combinando diferentes técnicas computacionales y experimentales, entre las técnicas computacionales que empleamos destacan el virtual screening, modelado por homología, acoplamiento molecular o docking, dinámica molecular acoplada a métodos de cálculos de energía (MMGBSA, MMPBSA y PMF) y métodos híbridos que combinan métodos de mecánica molecular (dinámica molecular) y mecánica cuántica (métodos QMMM). Los métodos experimentales que ocupamos para correlacionar los datos computacionales y experimentales son mediante ensayos de fluorescencia, luminiscencia y cultivo celular.

Recientemente, dada la importancia de los nanoacarreadores en la industria farmacéutica como potenciales transportadores de fármacos poco solubles, realizamos estudios computacionales que generen información relevante sobre el mecanismo molecular de transporte de fármacos de interés farmacéutico por dendrímeros tipo PAMAM de diferentes generaciones, ciclodextrinas y algunas proteínas.